MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 strain Lactococcus lactis subsp. lactis strain plasmid 1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022587	AAGAAA	2	12	73	84	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022587	T	6	6	106	111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022587	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022587	GCC	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	554074372
5	NC_022587	CAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074372
6	NC_022587	T	7	7	362	368	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
7	NC_022587	ATT	2	6	373	378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
8	NC_022587	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
9	NC_022587	ATT	2	6	472	477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
10	NC_022587	TAC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074373
11	NC_022587	ATT	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
12	NC_022587	T	6	6	502	507	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
13	NC_022587	T	6	6	512	517	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
14	NC_022587	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
15	NC_022587	A	6	6	533	538	100 %	0 %	0 %	0 %	554074373
16	NC_022587	AAT	2	6	573	578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
17	NC_022587	TTCT	2	8	587	594	0 %	75 %	0 %	25 %	554074373
18	NC_022587	ATG	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074373
19	NC_022587	TTAT	2	8	672	679	25 %	75 %	0 %	0 %	554074373
20	NC_022587	TAA	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
21	NC_022587	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
22	NC_022587	TCA	2	6	773	778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074373
23	NC_022587	AAT	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
24	NC_022587	GAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074373
25	NC_022587	ATT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
26	NC_022587	AAC	2	6	894	899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074373
27	NC_022587	AAT	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074373
28	NC_022587	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	554074373
29	NC_022587	TTAAT	2	10	968	977	40 %	60 %	0 %	0 %	554074373
30	NC_022587	ATT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
31	NC_022587	ATTT	2	8	1075	1082	25 %	75 %	0 %	0 %	554074373
32	NC_022587	T	6	6	1095	1100	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
33	NC_022587	ATG	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074373
34	NC_022587	AAC	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074373
35	NC_022587	TGG	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554074373
36	NC_022587	A	6	6	1584	1589	100 %	0 %	0 %	0 %	554074373
37	NC_022587	ACTA	2	8	1629	1636	50 %	25 %	0 %	25 %	554074373
38	NC_022587	T	7	7	1638	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	554074373
39	NC_022587	TTG	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554074373
40	NC_022587	TAT	2	6	1703	1708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
41	NC_022587	TAT	3	9	1745	1753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
42	NC_022587	TAT	2	6	1769	1774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
43	NC_022587	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074373
44	NC_022587	A	6	6	2023	2028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022587	TTTA	2	8	2071	2078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022587	CAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022587	T	8	8	2113	2120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022587	TCA	3	9	2160	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022587	T	7	7	2211	2217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022587	ACAAAA	2	12	2233	2244	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	554074374
51	NC_022587	AGA	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074374
52	NC_022587	TTTTGA	2	12	2535	2546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554074374
53	NC_022587	TGA	2	6	2604	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074374
54	NC_022587	AATTG	2	10	2610	2619	40 %	40 %	20 %	0 %	554074374
55	NC_022587	ATGA	2	8	2622	2629	50 %	25 %	25 %	0 %	554074374
56	NC_022587	TTA	2	6	2634	2639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074375
57	NC_022587	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	554074375
58	NC_022587	CAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074375
59	NC_022587	AAAG	2	8	2733	2740	75 %	0 %	25 %	0 %	554074375
60	NC_022587	GAA	3	9	2812	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074375
61	NC_022587	AAT	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074375
62	NC_022587	GGA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554074375
63	NC_022587	A	6	6	3024	3029	100 %	0 %	0 %	0 %	554074375
64	NC_022587	TGA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554074375
65	NC_022587	GAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074375
66	NC_022587	TAA	2	6	3129	3134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074375
67	NC_022587	A	6	6	3133	3138	100 %	0 %	0 %	0 %	554074375
68	NC_022587	TGAA	2	8	3139	3146	50 %	25 %	25 %	0 %	554074375
69	NC_022587	A	8	8	3145	3152	100 %	0 %	0 %	0 %	554074376
70	NC_022587	CAA	2	6	3207	3212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074376
71	NC_022587	A	6	6	3216	3221	100 %	0 %	0 %	0 %	554074376
72	NC_022587	CAA	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074377
73	NC_022587	AATTAA	2	12	3328	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554074377
74	NC_022587	AACA	2	8	3340	3347	75 %	0 %	0 %	25 %	554074377
75	NC_022587	AAAT	2	8	3359	3366	75 %	25 %	0 %	0 %	554074377
76	NC_022587	TGAA	2	8	3427	3434	50 %	25 %	25 %	0 %	554074377
77	NC_022587	CTTT	2	8	3461	3468	0 %	75 %	0 %	25 %	554074377
78	NC_022587	AGA	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
79	NC_022587	A	8	8	3570	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	554074377
80	NC_022587	GAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
81	NC_022587	ATC	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554074377
82	NC_022587	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554074377
83	NC_022587	AATAGT	2	12	3684	3695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	554074377
84	NC_022587	CAA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554074377
85	NC_022587	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377
86	NC_022587	GAA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554074377
87	NC_022587	A	6	6	3818	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	554074377
88	NC_022587	TGG	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554074377
89	NC_022587	ATT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377
90	NC_022587	TTA	2	6	4084	4089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554074377

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.